Нова Вавилония
Съвременна Вавилония е периодът, който започва с влизането на цар Кир II във Вавилон. Оттогава градът никога не е бил независим, но историята му продължава. Влизайки във Вавилон в края на 5 век пр.н.е. пр. н. е. Кир получава официалната титла „цар на Вавилон“. По време на управлението на персите Вавилон остава важен град, една от автономиите, включени в персийското царство. На практика нищо не се е променило в живота на гражданите - градът не е разграбен, но благородниците остават на местата си.
През 481 пр.н.е в Персия владетелят се сменя, но ситуацията във Вавилон остава неизвестна. Вавилонците не можеха да носят оръжие, но периодично бяха набирани в армията - много вавилонци загинаха по време на войната с Гърция. Градът остава великолепен и блестящ, но някои религиозни сгради и могъщите стени на Вавилон са разрушени до края на 3 век пр.н.е. д. след потушаването на бунта на Шамаш-Ериба.
Към края на 3 век пр.н.е. Александър Велики нанася съкрушително поражение на персите. През 331 пр.н.е пр. н. е. придобива Вавилон, почита бог Бел с жертвоприношение, след което приема титлата "цар на Вавилон" и дори древната титла на асирийските владетели - "цар на четирите краища на света". Македонците остават в града не повече от месец. Александър нареди изграждане и ремонт на повредени сгради. Той също така нареди възстановяването на "Вавилонската кула" - зикурата Етеменанки. Македон обаче скоро умря и огромната му държава се разпадна. След дълги войни Вавилон е превзет от империята на Селевкидите, чийто владетел построява нов голям град недалеч от Вавилон, в резултат на което последният запада и съвременната Вавилония се свежда до малко селище. През 636 г. сл. н. е в. Арабският халифат превзе Месопотамия и последните руини на Вавилон бяха опънати върху тухли.